Основной задачей судебно-медицинской службы является оказание содействия судам, органам дознания, лицам, производящим дознание, следователям и прокурорам в установлении обстоятельств, подлежащих доказыванию по конкретному делу, посредством разрешения вопросов, требующих медицинских знаний. Кроме того, бюро является информационной базой для составления статистических отчётов о структуре смертности в Российской Федерации.

Судебно-медицинские эксперты принимают участие на этапах предварительного следствия, следственных экспериментах, заседаниях в судах. Кроме того, судебно-медицинские эксперты доводят до сведения органы здравоохранения о выявленных недостатках в оказании лечебной помощи и диагностики, извещают о случаях острозаразных заболеваний, анализируют данные скоропостижной смерти, отравлений, травматизма, ведут научные разработки конкретных проблем патологии человека с внедрением данных в судебно-медицинскую практику. Проведение судебно-медицинских экспертиз осуществляется на основе действующих в Российской Федерации уголовного, гражданского и процессуального законодательств, федерального закона «О государственной судебно-экспертной деятельности в Российской Федерации», постановлений правительства, приказов и инструкций Министерства здравоохранения и социального развития РФ, ФЦ СМЭ.

Задачи судебно-медицинской службы можно сформулировать следующим образом:

•         производство судебно-медицинских экспертиз и исследований трупов в целях установления или исключения признаков насильственной смерти, определения её причины;

•         характера, механизма и сроков образования телесных повреждений;

•         установления давности наступления смерти, а также разрешения других вопросов, поставленных правоохранительными органами;

•         производство судебно-медицинских экспертиз и обследований потерпевших, обвиняемых и др. лиц для определения тяжести вреда, причинённого здоровью, механизма и давности образования телесных повреждений, половых преступлений и решения других вопросов, требующих специальных познаний в области судебной медицины;

•         производство судебно-медицинских экспертиз (комиссионных, комплексных) по материалам гражданских и уголовных дел;

•         проведение экспертиз и исследований вещественных доказательств;

•         участие судебно-медицинских экспертов в качестве специалистов в области судебной медицины первоначальных и других следственных действиях.