1. Отдел судебно-медицинской экспертизы потерпевших

2. Отдел судебно-медицинской экспертизы трупов

3. Отдел комплексных экспертиз

4. Медико-криминалистическое отделение

5. Судебно-химическое отделение

6. Судебно-гистологическое отделение

7. Судебно-биологическое отделение

8. Молекулярно-генетическое отделение

9. Междуреченское городское отделение

10. Мысковское городское отделение

11. Осинниковское городское отделение

12. Таштагольское городское отделение